Cornélius a Lapide mourut à Rome, le 12 mars 1637, à l'âge de plus de soixante-dix ans. Il laissait en manuscrit des commentaires sur les Évangiles et sur la plupart des livres historiques de l'Ancien Testament.
Écrits sans ordre, à différentes époques, les commentaires de Cornélius a Lapide comprennent toute la Bible, sauf le livre de Job et celui des Psaumes , sur lesquels il n'a laissé que dro notes incomplètes qui n'ont jamais été publiées.
Le savant jésuite ne se contente pas d'exposer d'une manière claire et précise les divers sens du texte sacré. A cette partie qui forme la base de tout commentaire, il joint le résumé de la doctrine des grands théologiens sur tous les points importants du dogme ou de la morale, des citations très nombreuses et très variées des Pères, des auteurs ascétiques et même des philosophes et des poètes païens, enfin des traits choisis de l'histoire ecclésiastique et profane et de la vie des saints. En un mot, il embrasse à peu près dans toute son étendue la vraie science , c'est-à-dire la science de Dieu , de l'homme et du monde étudiée au flambeau de la révélation, le seul qui jette sur Jes mystères d'ici-bas une lumière satisfaisante.
Cornélius a Lapide nous semble être non-seulement le meilleur et le plus complet des commentateurs qu'a fournis en si grand nombre l'école catholique du XVIe siècle, mais peut-être le premier de tous, du moins dans le genre qu'il a adopté, et qui est excellent.